「Activity Memo the 2nd」 で、StyleCatcherプラグインを使用できるようにLaCoocanがサーバ設定を変更したことを教えていただきました。
Bootstrap.pmをオリジナルのものに戻してみたところ、ちゃんと動作することが確認できました。
LaCoocanでの設定変更ですが、どうやらCGIの起動時に環境変数PWDを設定するようにしたようです。これでMT::Bootstrapがカレントディレクトリの絶対パスを得られるようになり、そこからMTのインストールパスを取得できるようになりました。
今回の件はMT::Bootstrapの不具合のような気がしていますが、何らかの理由(性能とか)でこのようになっているのかも知れず、Perlにあまり詳しくない自分としては不具合と断定できません。